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Année académique 2017-2018
21/08/2018
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Dernière modification : le 02/02/2018 par DEFRANCE, Matthieu

Langue/Language


Advanced Methods in Bioinformatics
INFO - F439

I. Informations générales
Intitulé de l'unité d'enseignement * Advanced Methods in Bioinformatics
Langue d'enseignement * Enseigné en anglais
Niveau du cadre de certification * Niveau 7 (2e cycle-MA/MC/MA60)
Discipline * Informatique
Titulaire(s) * [y inclus le coordonnateur] Matthieu DEFRANCE (coordonnateur), Wim VRANKEN
II. Place de l'enseignement
Unité(s) d'enseignement co-requise(s) *
Unité(s) d'enseignement pré-requise(s) *
Connaissances et compétences pré-requises *
Programme(s) d'études comprenant l'unité d'enseignement - CEPULB - Conseil de l'Éducation Permanente de l'Université Libre de Bruxelles (5 crédits, optionnel)
- M-BINFA - Master en bioinformatique et modélisation, à finalité approfondie (5 crédits, optionnel)
- M-INFOS - Master en sciences informatiques (5 crédits, optionnel)
- M-IRIFS - Master en ingénieur civil en informatique, à finalité spécialisée (5 crédits, optionnel)
III. Objectifs et méthodologies
Contribution de l'unité d'enseignement au profil d'enseignement *
Objectifs de l'unité d'enseignement (et/ou acquis d'apprentissages spécifiques) *

This course focusses on computational biology.

The goal of this course is to provide students with the necessary skills i) to understand computational biology research, ii) to grasp the workings of some of the key algorithms that were developed to solve particular problems in molecular biology iii) to understand the role of different computational methods in solving these problems, iv) to know where certain molecular data can be found and how to combine this, v) to be able to develop a project that tries to solve some problem in this domain. In addition, this knowledge will allow you to understand the literature on bioinformatics and computational biology.

Contenu de l'unité d'enseignement *

This course will provide an introduction to computational methods applied to biological questions. After an introduction to the computational biology domain, the notion of sequence aliment, motif discovery, protein structure will be detailed. A particular emphasis will be put on notion related to protein structure prediction and methods related to Next Generation Sequencing data analysis.

Méthodes d'enseignement et activités d'apprentissages *

Presentations + assignments

Support(s) de cours indispensable(s) * Non
Autres supports de cours
Références, bibliographie et lectures recommandées *

Provided in the slides

IV. Evaluation
Méthode(s) d'évaluation *

During the course sessions, students will receive assignments. These assignments will be graded and the points will be used in the calculation of the final course grade.

For the exam, students will present an article, discussing the context, methods. results and conclusions drawn by the authors.

The quality of the project and the quality of the presentation (together with the points for the assignments) will determine the final points for this course.

Construction de la note (en ce compris, la pondération des notes partielles) *

50% on the assignments

50% on the article + presentation

Langue d'évaluation *

Anglais

V. Organisation pratique
Institution organisatrice * ULB
Faculté gestionnaire * Sciences
Quadrimestre * Deuxième quadrimestre (NRE : 25462, 48124)
Horaire * Deuxième quadrimestre
Volume horaire
VI. Coordination pédagogique
Contact *

matthieu.dc.defrance@ulb.ac.be

Lieu d’enseignement *

VUB campus

VII. Autres informations relatives à l’unité d’enseignement
Remarques

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