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Année académique 2017-2018
20/10/2017
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Dernière modification : le 19/09/2017 par OP DE BEECK, Anne

Langue/Language


Molecular biology and microbiology
BIME - H406

I. Informations générales
Intitulé de l'unité d'enseignement * Molecular biology and microbiology
Langue d'enseignement * Enseigné en anglais
Niveau du cadre de certification * Niveau 7 (2e cycle-MA/MC/MA60)
Discipline * Sciences biomédicales
Titulaire(s) * [y inclus le coordonnateur] Anne OP DE BEECK (coordonnateur), Anne BOTTEAUX, Yvan DE LAUNOIT, Jason PERRET
II. Place de l'enseignement
Unité(s) d'enseignement co-requise(s) *
Unité(s) d'enseignement pré-requise(s) *
Connaissances et compétences pré-requises * BIME-H302 - Biologie générale et anatomo-physiologie humaine CHIM-H312 - Chimie biologique
Programme(s) d'études comprenant l'unité d'enseignement - CEPULB - Conseil de l'Éducation Permanente de l'Université Libre de Bruxelles (5 crédits, obligatoire)
- M-IRCBS - Master en ingénieur civil biomédical (5 crédits, obligatoire)
III. Objectifs et méthodologies
Contribution de l'unité d'enseignement au profil d'enseignement *

Cette unité d'enseignement contribue aux compétences suivantes :

  • Mesurer les grandeurs physico-chimiques liées au vivant, tant morphologique que fonctionnel
  • Communiquer efficacement, tant de manière écrite qu’orale, avec des collègues ingénieurs, mais aussi avec les autres acteurs du domaine biomédical et s’intégrer dans une équipe pluridisciplinaire

 

Objectifs de l'unité d'enseignement (et/ou acquis d'apprentissages spécifiques) *

Au terme de cet enseignement les étudiants seront capables :

-      de faire appel aux notions de virologie acquises afin de comprendre des problèmes virologiques.

-      de faire appel aux notions de bactériologie et de comprendre les bases moléculaires des problèmes liés aux contaminations nosocomiales, aux biofilms,  à la stérilisation,  au développement  des matériaux « anti-microbiens» (Dr Anne Botteaux)

-      d’interpréter des résultats d’expériences d’analyse virologique types (PCR, cytométrie en flux)

-      De faire appel aux notions de biochimie des acides nucléiques (biologie moléculaire)

-      de faire appel aux notions de biologie moléculaire  et d'tiliser ces notions afin de comprendre les outils, techniques et applications de biologie moléculaire (génie génétique).

 

Contenu de l'unité d'enseignement *

Cette unité d’enseignement (UE) regroupe 2 unités d’apprentissage (UA) :

-       Microbiologie médicale virologique et bactériologique :

  • Notion de base de virologie
  • Bases cellulaires et moléculaires de la réponse antivirale et de la pathogenèse associée à certaines infections virales type (Influenza, HIV, hépatite C, Ebola, HPV)
  • Utilisation de techniques de biologie moléculaire (PCR en temps réel, cytométrie en flux)  et cellulaire (culture de virus sur cellules) et des machines correspondantes pour répondre à une question pratique de virologie (TP)
  • Notions approfondies de bactériologie (Dr Anne Botteaux)

- Eléments de génie génétique

  • Les acides nucléiques - Structure des gènes et des génomes - Organisation de la chromatine - Réplication et réparation de l'ADN - La transcription et le contrôle de l'expression des gènes - La maturation des transcrits, l'épissage et l'édition - Les mécanismes de régulation par les petits ARNs
  • Eléments de Génie Génétique (ou les techniques de biologie moléculaire) :
    • les outils: enzymes (restriction, polymérases, …); vecteurs; bactéries; cellules eucaryotes; …
    • les techniques: Purifications d'acides nucléiques (ADN, ARN,…), clonage, restrictions, PCR, transformation, transfections, électrophorèse, Southern/Northern blot; RT-qPCR, séquençage, microarray, RNA-Seq, Talen & CRISPR/Cas9, Épigénétique (ChIP, MSP, Bisulfite), ….
  • les applications: systèmes d'expression, animaux génétiquement modifiés (knockout, transgènes, …), diagnostique de maladies génétiques, …

 

Méthodes d'enseignement et activités d'apprentissages *

-       Microbiologie médicale : Cours magistral (24h) et travaux pratiques (12h)

La présence aux travaux pratiques est obligatoire. L'absence aux TP empêchera la validation de l'UE.

-      Eléments de génie génétique: Cours magistral (24h)

 

Support(s) de cours indispensable(s) * Oui
Autres supports de cours
Références, bibliographie et lectures recommandées *

-       Microbiologie médicale :

  • virologie : Fields Virology 6th edition, Editors Knipe & Howley, 2013
  • bactériologie : Prescott’s Microbiology 9th  édition,  Willey, Sherwood and Woolverton, McGraw-Hill International Edition

-       Eléments de génie génétique:

  • Genes X (10ième édition ou après) de J. Krebs, E. Goldstein & S Kilpatrick
  • Molecular Biology of the Gene (Watson, Baker, Bell, Gann, Levine & Losick) 5ième ou 6ième éditions ou après.
  • Lehninger Principles of Biochemistry (Nelson & Cox) 4ième ou 5ième éditions ou après
IV. Evaluation
Méthode(s) d'évaluation *

Examen oral 

Construction de la note (en ce compris, la pondération des notes partielles) *

La note finale de l’unité d’enseignement correspond à la moyenne arithmétique des notes finales obtenues pour chaque activité d’apprentissage (AA). Si le chiffre de la première décimale est = ou supérieur à 5, la note sera arrondie à l’unité supérieure, si le chiffre de la première décimale est inférieur à 5, la note sera arrondie à l’unité inférieure.

La note de l'AA de microbiologie moléculaire comportera pour 25% la cote de bactériologie et pour 75% la virologie. Une cote inférieure à 10/20 dans l'une de ces 2 parties conduira à l'échec de cette AA et donc à l'échec de l'UE.

Si une des notes est inférieure à 10/20, cette note sera considérée comme la note finale de l’unité d’enseignement, cependant seule l’activité d’apprentissage pour laquelle la note est inférieure à 10/20, sera représentée en 2e session. Les cotes des activités d'apprentissage réussies en première session seront reportées dans la moyenne de 2e session.

Si en 2e session, l’étudiant obtient une note inférieure à 10/20 pour l’une des activité d'apprentissage, la plus petite note sera attribuée à l’ensemble de l’UE, ce qui conduira à l’échec de l’UE, qui ne pourra dès lors pas être créditée.

Report de cote d'une année à l'autre :

Les cotes des activités d'apprentissage au sein d'une UE peuvent être reportées d'une année  à l'autre pour autant que ces cotes soient de 12 ou plus et que la moyenne de l'UE fût de 10. Toutefois ce report n'est possible qu'une seule fois.

Langue d'évaluation *

Anglais ou francais au choix de l'étudiant

V. Organisation pratique
Institution organisatrice * ULB
Faculté gestionnaire * Ecole polytechnique Bruxelles
Quadrimestre * Premier quadrimestre (NRE : 40020)
Horaire * Premier quadrimestre
Volume horaire

Microbiologie médicale virologique : 24h théorie + 12h TP

Eléments de génie génétique: 24 h théorie

VI. Coordination pédagogique
Contact *

Microbiologie médicale virologique: Anne Op de beeck
Tél 02 555 60 81   adresse mail :  Anne.op.de.beeck@ulb.ac.be

Lieu d’enseignement *

Microbiologie médicale virologique : Erasme

Eléments de génie génétique: Solbosch

VII. Autres informations relatives à l’unité d’enseignement
Remarques

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