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Année académique 2010-2011
17/10/2018 |
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Analysis of biomolecular interaction networks |
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| I. Informations générales | |
| Intitulé de l'unité d'enseignement * | Analysis of biomolecular interaction networks |
| Langue d'enseignement * | Enseigné en français |
| Niveau du cadre de certification * | Niveau 7 (2e cycle-MA/MS/MA60) |
| Discipline * | Biologie moléculaire |
| Titulaire(s) * [y inclus le coordonnateur] |
Jacques VAN HELDEN (coordonnateur) |
| II. Place de l'enseignement | |
| Unité(s) d'enseignement co-requise(s) * | |
| Unité(s) d'enseignement pré-requise(s) * | |
| Connaissances et compétences pré-requises * | |
| Programme(s) d'études comprenant l'unité d'enseignement |
- BINF5A - Master en bioinformatique et modélisation, à finalité approfondie - 2e année (2 crédits, optionnel) - IRBC5S-I - Master en bioingénieur : chimie et bio-industries, à finalité spécialisée - 2e année - Master en bioingénieur : chimie et bio-industries, Option Bioinformatique - 2e année (2 crédits, optionnel) - IRCB5I - Master en ingénieur civil biomédical, à finalité Informatique et imagerie biomédicales - 2e année (2 crédits, optionnel) |
| III. Objectifs et méthodologies | |
| Contribution de l'unité d'enseignement au profil d'enseignement * | |
| Objectifs de l'unité d'enseignement (et/ou acquis d'apprentissages spécifiques) * | Le but de ce cours sera de présenter les applications de l'algorithmique des graphes à l'analyse des réseaux d'interactions moléculaires (régulation transcriptionnelle, réseaux métaboliques, réseaux d'interactions protéiques). |
| Contenu de l'unité d'enseignement * | Le cours inclura notamment une présentation des différents modèles statistiques pour la genèse de réseaux aléatoires, les propriétés topologiques des réseaux (connectivité, rayons, robustesse, …), la recherche de chemins, la recherche de motifs, le clustering sur les graphes et la détection de modules fortement connectés, et la visualisation de graphes. Les travaux pratiques consisteront à utiliser des logiciels d'analyse de graphes pour analyser des réseaux d'interactions moléculaires. Les approches et exemples traités s'adapteront à l'évolution des publications du domaine. |
| Méthodes d'enseignement et activités d'apprentissages * | 2 ECTS (théorie: 1, exercices: 0, travaux pratiques: 1, travaux personnels: 0). Le cours se donnera en français, les supports écrits seront en anglais. |
| Support(s) de cours indispensable(s) * | |
| Autres supports de cours | |
| Références, bibliographie et lectures recommandées * | La bibliographie consistera en sélections d'articles soumis à discussion, et adaptés chaque année en fonction de l'actualité scientifique. |
| IV. Evaluation | |
| Méthode(s) d'évaluation * | Examen écrit |
| Construction de la note (en ce compris, la pondération des notes partielles) * | |
| Langue d'évaluation * | |
| V. Organisation pratique | |
| Institution organisatrice * | ULB |
| Faculté gestionnaire * | Sciences |
| Quadrimestre * |
Premier quadrimestre (NRE : 17833) |
| Horaire * | Premier quadrimestre |
| Volume horaire | |
| VI. Coordination pédagogique | |
| Contact * | Email: Jacques.van.Helden@ulb.ac.be Localisation du bureau: Campus Plaine, Bâtiment BC, aile C, local C6.102. Adresse postale: SCMBB - Université Libre de Bruxelles. Campus Plaine. CP 263. Boulevard du Triomphe. 1050 Bruxelles - Belgium |
| Lieu d’enseignement * | |
| VII. Autres informations relatives à l’unité d’enseignement | |
| Remarques | |
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